52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0698 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0698  Abortive infection protein  100 
 
 
244 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  72.08 
 
 
284 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  45.32 
 
 
285 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  42.11 
 
 
275 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  42.64 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  42.64 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  40 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  40.91 
 
 
448 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  40.91 
 
 
448 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  39.02 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.65 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  43.9 
 
 
453 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  40 
 
 
196 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  30.67 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  28.26 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  30.21 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  36.59 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  42.86 
 
 
453 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  34.74 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  41.46 
 
 
453 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  39.56 
 
 
280 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  39.77 
 
 
420 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  36.71 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  40 
 
 
420 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  38.54 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  37.8 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  38.54 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  33.73 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  31.82 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  38.54 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  38.54 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  34.15 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  29.75 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  37.5 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  30.53 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  38.61 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  33.75 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  38.04 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  31.82 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1579  Abortive infection protein  34.67 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.468328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  36.05 
 
 
308 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  29.67 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  40 
 
 
308 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  30.61 
 
 
240 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  33 
 
 
265 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  32 
 
 
317 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>