26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1301 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  351  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  96.59 
 
 		 176 aa  313  7e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  94.97 
 
 		 176 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  78.53 
 
 		 171 aa  264  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  64.57 
 
 		 211 aa  226  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  37.42 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  33.99 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  33.12 
 
 		 152 aa  90.9  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  35.76 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  32.5 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  33.54 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  34.84 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  34.87 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  32.92 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  28.93 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  32.72 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  32.72 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  28.48 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  28.76 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  33.94 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2059  PilT domain-containing protein  32.48 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  33.33 
 
 		 481 aa  48.9  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.191638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>