23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3470 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  63.29 
 
 		 159 aa  206  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  43.87 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  47.1 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  43.79 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  38.31 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  37.66 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  38.51 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  42.86 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  96.7  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  39.13 
 
 		 160 aa  94  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  32.48 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  37.27 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  35.98 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  35 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  33.75 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  32.91 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  35.56 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  31.01 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  30.19 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  29.29 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>