16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2287 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  100 
 
 
113 aa  217  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.191638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  66.97 
 
 
114 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2059  PilT domain-containing protein  73.15 
 
 
116 aa  140  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1929  PilT domain-containing protein  74.55 
 
 
114 aa  122  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0437  PilT domain-containing protein  34.58 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  26.61 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  27.52 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  26.61 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  32.23 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  34.51 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  24.55 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  27.43 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  28.07 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  36.21 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  28.7 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0687  hypothetical protein  34.41 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.189758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>