20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2059 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2059  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  224  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  69.09 
 
 		 114 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  73.15 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.191638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1929  PilT domain-containing protein  81.42 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  31.62 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  32.46 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  29.66 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  37.07 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  40.16 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  35.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  34.17 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  27.97 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0437  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  30.17 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  27.43 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  26.89 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>