14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1614 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  218  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  66.96 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0896  PilT domain-containing protein  67.86 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.996154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  62.5 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  32.17 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  30.77 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 		 385 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  30.7 
 
 		 269 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  33.33 
 
 		 388 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2242  PilT domain-containing protein  24.79 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.335681  hitchhiker  0.00203626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  27.52 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  33.03 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  36 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>