26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0577 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  95.45 
 
 
176 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  94.97 
 
 
176 aa  305  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  76.07 
 
 
171 aa  257  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  64.57 
 
 
211 aa  226  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  38.06 
 
 
154 aa  104  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  37.91 
 
 
152 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  35.95 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  33.75 
 
 
152 aa  90.9  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  36.42 
 
 
161 aa  89  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  35.48 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  31.87 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  34.16 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  32.1 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  33.55 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  28.66 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  31.87 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  32.1 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  29.41 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  28.48 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  33.03 
 
 
114 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  38.89 
 
 
481 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2059  PilT domain-containing protein  32.48 
 
 
116 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  27.52 
 
 
113 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.191638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>