25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0036 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  49.67 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  34.55 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  33.54 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  33.77 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  33.11 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  32.1 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  32.92 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  28.48 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  31.68 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  30.52 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  31.41 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  30.19 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  26.8 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  30.52 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  24.84 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  29.03 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  25.49 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  25.45 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2287  PilT domain-containing protein  28.07 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.191638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  29.2 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>