18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42470 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  100 
 
 		 481 aa  995    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08253  proteasome maturation ans ribosome synthesis protein Nop10, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04000)  32.56 
 
 		 431 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04300  art-4 protein, putative  32.71 
 
 		 494 aa  189  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31725  predicted protein  29.95 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  34.29 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  38.95 
 
 		 151 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  33.87 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  42.47 
 
 		 159 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  37.08 
 
 		 211 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  35.19 
 
 		 154 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  33.71 
 
 		 152 aa  47  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  33.75 
 
 		 164 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1520  hypothetical protein  28.05 
 
 		 188 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000148415  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  33.68 
 
 		 160 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>