25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1520 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1520  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000148415  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0272  hypothetical protein  49.01 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000221708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0290  hypothetical protein  47.68 
 
 
152 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000205866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0242  hypothetical protein  48.67 
 
 
154 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5054  hypothetical protein  47.68 
 
 
152 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000157699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0277  hypothetical protein  47.02 
 
 
152 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0242  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000114479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0228  hypothetical protein  47.02 
 
 
152 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000151514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0230  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000347218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0257  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000335801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0268  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0235  hypothetical protein  47.97 
 
 
162 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000188851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0215  hypothetical protein  47.65 
 
 
155 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0320  hypothetical protein  47.97 
 
 
147 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1096  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1675  hypothetical protein  47.06 
 
 
151 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2136  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000919128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2099  hypothetical protein  47.37 
 
 
151 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000181364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0539  hypothetical protein  46.62 
 
 
150 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.29099  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0287  hypothetical protein  47.3 
 
 
150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0717  hypothetical protein  41.22 
 
 
146 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0733  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1361  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  102  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.297184  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  38.98 
 
 
481 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  27.39 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>