24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1315 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  84.21 
 
 
154 aa  273  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  75.66 
 
 
152 aa  249  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  73.68 
 
 
152 aa  245  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  65.13 
 
 
152 aa  214  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  44 
 
 
166 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  41.89 
 
 
151 aa  110  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  37.16 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  37.16 
 
 
162 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  38.46 
 
 
211 aa  103  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  38 
 
 
158 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  37.09 
 
 
160 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  37.91 
 
 
176 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  39.07 
 
 
149 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  37.25 
 
 
176 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  36.71 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  36.6 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  36.6 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  34.76 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  31.37 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  30.72 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  26.8 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  33.71 
 
 
481 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>