26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2682 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  84.21 
 
 
152 aa  273  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  75 
 
 
152 aa  250  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  75.66 
 
 
152 aa  249  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  63.82 
 
 
152 aa  206  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  48.09 
 
 
166 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  38.16 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  37.16 
 
 
162 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  43.92 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  39.07 
 
 
160 aa  110  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  39.33 
 
 
159 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  37.42 
 
 
176 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  37.82 
 
 
211 aa  103  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  38.06 
 
 
176 aa  103  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  37.42 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  39.19 
 
 
158 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  38.22 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  34.64 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  36.31 
 
 
311 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  28.1 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  29.41 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  35.19 
 
 
481 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1313  Quinolinate phosphoribosyl transferase  31.31 
 
 
391 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  53.33 
 
 
373 aa  40.8  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>