25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2062 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  65.13 
 
 		 152 aa  214  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  63.82 
 
 		 154 aa  206  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  62.5 
 
 		 152 aa  206  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  61.84 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  42.28 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  38.41 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  42.57 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  36.49 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  35.14 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  38 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  36.91 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  33.94 
 
 		 211 aa  92  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  36.94 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  33.75 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  32.92 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  31.87 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  33.99 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  29.75 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  32.3 
 
 		 311 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  27.45 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  34.78 
 
 		 481 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>