30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0130 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 161 aa  336  8e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  38.16 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  37.16 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  40.15 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  38.41 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  35.76 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  36.42 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  36.42 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  34.67 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  37.09 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  35.76 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  34.62 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  33.12 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  32.08 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  34.64 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  33.11 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  35.53 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  33.56 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  29.27 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  47.83 
 
 		 346 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 368 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 368 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  32.73 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08253  proteasome maturation ans ribosome synthesis protein Nop10, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04000)  29.09 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31725  predicted protein  34.48 
 
 		 629 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  30.4 
 
 		 383 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>