More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2639 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2639  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2865  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2762  maleylacetoacetate isomerase  95.35 
 
 		 215 aa  407  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3679  maleylacetoacetate isomerase  89.2 
 
 		 215 aa  374  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.384029  normal  0.429987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0562  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0201536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  48.4 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  45.67 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  43.93 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  43.93 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  43.32 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  42.52 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  42.45 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  42.52 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  41.98 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  43.75 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  40.93 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  43.27 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  41.94 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  39.17 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  38.79 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  40.55 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  41.94 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  39.55 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  39.62 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  42.5 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  42.5 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  41.5 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  42.5 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  40.65 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  41.9 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  39.63 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  38.91 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  39.72 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  43.4 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  41.9 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  37.56 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  40.39 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  41.51 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  39.15 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  40.09 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  41.43 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  36.15 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  39.62 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  37.96 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  40.28 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  37.8 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  37.8 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  37.8 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  37.8 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  39.15 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.21 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  40.55 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  41.75 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  36.87 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  36.84 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  40.48 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  41.88 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  35.89 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  39.05 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  42.58 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  36.87 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  36.87 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  34.93 
 
 		 214 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  36.45 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  37.67 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  37.27 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  38.83 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  39.05 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  41.01 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  37.91 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  39.81 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  38.6 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  36.79 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  39.52 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2626  maleylacetoacetate isomerase  42.93 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.503321 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  41.12 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  41.01 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  37.96 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>