21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1104 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 107 aa  216  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  71.03 
 
 		 107 aa  168  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  71.03 
 
 		 107 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  71.03 
 
 		 107 aa  166  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  56.07 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  28.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  35.23 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  33.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  36.59 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  29.57 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  28.81 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  30.43 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  30.11 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  26.96 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0579  RNA polymerase Rpb4  31.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.952772  hitchhiker  0.00157455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  33.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  31.91 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1569  RNA polymerase Rpb4  30.34 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  26.96 
 
 		 118 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  28.57 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  30.7 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>