12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0352 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  33.64 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  32.43 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0579  RNA polymerase Rpb4  34 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.952772  hitchhiker  0.00157455 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1383  RNA polymerase Rpb4  29.25 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  36.59 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  31 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  29.36 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1569  RNA polymerase Rpb4  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  34.15 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  34.15 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  34.15 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>