15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0855 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 107 aa  215  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  97.2 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  95.33 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  71.03 
 
 		 107 aa  168  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  52.34 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  34.48 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  32.86 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  29.7 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  29.91 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  31.3 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  28.7 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  27.96 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  28.81 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  34.15 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  29.57 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>