16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1982 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  37.27 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0579  RNA polymerase Rpb4  36.36 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.952772  hitchhiker  0.00157455 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1569  RNA polymerase Rpb4  35.45 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  34.55 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  32.43 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0062  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  29.76 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20245  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  32.86 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  32.86 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  31.43 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  30.43 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  33.78 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  31.08 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1807  RNA polymerase Rpb4  28.12 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  35.53 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1383  RNA polymerase Rpb4  26.58 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>