10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1749 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 111 aa  215  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1569  RNA polymerase Rpb4  76.79 
 
 		 112 aa  171  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0579  RNA polymerase Rpb4  73.87 
 
 		 111 aa  170  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.952772  hitchhiker  0.00157455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  74.77 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  34.55 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  29.36 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  31.91 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  38.89 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  32.38 
 
 		 118 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  32.74 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>