21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2389 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  87.29 
 
 		 118 aa  207  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  76.27 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  69.23 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  67.8 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  43.36 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  45.13 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  41.96 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  37.17 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  45.54 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  38.6 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  42.11 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  31.36 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  32.71 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  26.09 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  32.17 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  26.96 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  28.7 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  28.7 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  38.89 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1383  RNA polymerase Rpb4  23.01 
 
 		 108 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>