22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0764 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 104 aa  202  9e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  42.86 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  38.89 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  39.25 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  42.72 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  39.6 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  32.71 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  33.64 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  37.62 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  32.71 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  36.99 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  33.33 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  34.91 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  35.19 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0062  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  32 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20245  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  28.71 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  29.89 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  31 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  29.7 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  29.7 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  29.7 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1807  RNA polymerase Rpb4  31.91 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>