19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3232 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  100 
 
 		 129 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  59.69 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  58.04 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  54.87 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  53.98 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  50.44 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  45.13 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  47.41 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  47.32 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  41.96 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  39.29 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  40.18 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  40.18 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  42.86 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  30.11 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  27.96 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  28.42 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  27.96 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  26.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>