15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0904 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  100 
 
 		 129 aa  254  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  59.69 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  57.14 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  53.98 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  51.33 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  52.21 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  44.25 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  48.28 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  46.49 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  42.98 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  42.11 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  43.86 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  42.11 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  39.6 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  28.57 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>