20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0623 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 118 aa  230  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  69.23 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  71.79 
 
 		 118 aa  166  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  64.96 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  67.52 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  49.12 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  47.27 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  50.88 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  47.32 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  45.13 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  46.49 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  40 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  34.45 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  38.89 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  30.43 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0062  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  30.91 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20245  normal  0.0943991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1807  RNA polymerase Rpb4  25.89 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  31.3 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  31.3 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  26.96 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>