15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1584 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  100 
 
 		 107 aa  215  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  96.26 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  95.33 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  71.03 
 
 		 107 aa  166  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0056  RNA polymerase Rpb4  49.53 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0452503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  36.21 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  31.43 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  29.7 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  32.17 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  31.19 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  33.04 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  26.88 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  29.57 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  34.15 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  26.27 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>