10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0432 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0432  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  100 
 
 		 111 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0579  RNA polymerase Rpb4  72.97 
 
 		 111 aa  170  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.952772  hitchhiker  0.00157455 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1749  RNA polymerase Rpb4  74.77 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000570963  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1569  RNA polymerase Rpb4  73.21 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  37.27 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0352  RNA polymerase Rpb4  33.64 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  35.23 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0855  RNA polymerase Rpb4  29.91 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0580322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  31.19 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1091  RNA polymerase Rpb4  28.97 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.485657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>