27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1280 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1280  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  289  9e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1744  transglutaminase-like protein  45.45 
 
 		 214 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  46.55 
 
 		 492 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  44.26 
 
 		 485 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2650  transglutaminase domain protein  31.25 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  43.86 
 
 		 485 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  34.38 
 
 		 265 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  38.57 
 
 		 484 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  39.66 
 
 		 478 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.58 
 
 		 280 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  31.82 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  35.71 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  35.71 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  39.66 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  35.8 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 515 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 274 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  36.62 
 
 		 510 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 		 274 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 		 298 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>