33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3975 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3975    100 
 
 		 754 bp  1495    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  84.96 
 
 		 755 bp  583  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  84.96 
 
 		 755 bp  583  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    100 
 
 		 255 bp  486  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  86.34 
 
 		 426 bp  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  87.5 
 
 		 261 bp  254  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    83.77 
 
 		 356 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    80.56 
 
 		 758 bp  111  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    80.56 
 
 		 758 bp  111  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    94.87 
 
 		 758 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    94.87 
 
 		 1851 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  94.87 
 
 		 758 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  94.87 
 
 		 504 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    94.87 
 
 		 754 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    91.49 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    91.49 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    91.49 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    91.49 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  94.87 
 
 		 758 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 333 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0860    86.15 
 
 		 311 bp  58  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  87.72 
 
 		 393 bp  58  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4153    87.5 
 
 		 759 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    94.44 
 
 		 363 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3881    85.07 
 
 		 752 bp  54  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  89.36 
 
 		 393 bp  54  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  84 
 
 		 288 bp  54  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  89.36 
 
 		 519 bp  54  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  90.48 
 
 		 369 bp  52  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    96.55 
 
 		 850 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4939    91.89 
 
 		 342 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    93.75 
 
 		 781 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37300    88.64 
 
 		 883 bp  48.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>