25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4231 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4231    100 
 
 		 754 bp  1495    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  82.19 
 
 		 758 bp  404  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  82.06 
 
 		 758 bp  396  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    82.06 
 
 		 1851 bp  396  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    82.06 
 
 		 758 bp  396  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  83.54 
 
 		 504 bp  319  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  84.42 
 
 		 426 bp  266  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5704    93.29 
 
 		 234 bp  208  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0485245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    81.16 
 
 		 363 bp  168  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4939    88.59 
 
 		 342 bp  161  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    78.86 
 
 		 850 bp  133  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2784    80.06 
 
 		 449 bp  127  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  79.38 
 
 		 758 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  79.38 
 
 		 758 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    85.39 
 
 		 781 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    97.5 
 
 		 356 bp  71.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    94.87 
 
 		 255 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    94.87 
 
 		 754 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  92.5 
 
 		 755 bp  56  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  92.5 
 
 		 755 bp  56  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  92.5 
 
 		 261 bp  56  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>