37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6142 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6142    100 
 
 		 850 bp  1685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  90.38 
 
 		 426 bp  511  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2784    87.3 
 
 		 449 bp  414  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  81.19 
 
 		 758 bp  260  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    81.01 
 
 		 758 bp  252  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    81.01 
 
 		 1851 bp  252  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  81.01 
 
 		 758 bp  252  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    91.67 
 
 		 363 bp  250  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80.75 
 
 		 758 bp  224  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80.75 
 
 		 758 bp  224  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    93.88 
 
 		 781 bp  220  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  86.93 
 
 		 504 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    78.86 
 
 		 754 bp  133  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5704    86.72 
 
 		 234 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0485245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  92.68 
 
 		 755 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  92.68 
 
 		 755 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6072    84.42 
 
 		 285 bp  58  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  92.68 
 
 		 261 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    86.15 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    86.15 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    86.15 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    86.15 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    92.11 
 
 		 356 bp  52  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    96.55 
 
 		 255 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    96.55 
 
 		 754 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  93.75 
 
 		 1125 bp  48.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  90 
 
 		 474 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  90 
 
 		 531 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>