34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1779 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0734    99.87 
 
 		 799 bp  1576    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    99.87 
 
 		 799 bp  1576    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    100 
 
 		 799 bp  1584    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    100 
 
 		 799 bp  1584    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  95.83 
 
 		 261 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  95.83 
 
 		 755 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  95.83 
 
 		 755 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    93.75 
 
 		 356 bp  71.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2448    89.66 
 
 		 420 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.190631 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  91.84 
 
 		 758 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  91.84 
 
 		 504 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  91.84 
 
 		 758 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    91.84 
 
 		 1851 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    91.84 
 
 		 758 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    85.33 
 
 		 781 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    91.49 
 
 		 255 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    91.49 
 
 		 754 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  91.3 
 
 		 758 bp  60  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  91.3 
 
 		 758 bp  60  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4153    91.11 
 
 		 759 bp  58  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    86.15 
 
 		 850 bp  58  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    94.29 
 
 		 363 bp  54  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  86.44 
 
 		 288 bp  54  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  92.11 
 
 		 435 bp  52  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  89.13 
 
 		 429 bp  52  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    87.76 
 
 		 758 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    87.76 
 
 		 754 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    87.76 
 
 		 758 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 		 2526 bp  48.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>