38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7026 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7026    100 
 
 		 363 bp  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  84.18 
 
 		 758 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    84.18 
 
 		 758 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    84.18 
 
 		 1851 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  84.18 
 
 		 758 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  84.18 
 
 		 504 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    91.67 
 
 		 850 bp  250  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.45 
 
 		 758 bp  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.45 
 
 		 758 bp  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    81.16 
 
 		 754 bp  168  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    81.35 
 
 		 781 bp  157  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4939    87.27 
 
 		 342 bp  107  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2784    90.36 
 
 		 449 bp  101  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  97.22 
 
 		 755 bp  63.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  97.22 
 
 		 755 bp  63.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  97.22 
 
 		 261 bp  63.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  100 
 
 		 426 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    94.44 
 
 		 754 bp  56  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  92.5 
 
 		 531 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  92.5 
 
 		 369 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  92.5 
 
 		 474 bp  56  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    94.44 
 
 		 255 bp  56  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    94.29 
 
 		 799 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    94.29 
 
 		 799 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    94.29 
 
 		 799 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    94.29 
 
 		 799 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2282  hypothetical protein  96.77 
 
 		 309 bp  54  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    91.67 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3673    100 
 
 		 500 bp  46.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  46.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>