30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6165 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6165    100 
 
 		 781 bp  1548    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    93.88 
 
 		 850 bp  220  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    81.35 
 
 		 363 bp  157  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  78.66 
 
 		 758 bp  153  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  78.49 
 
 		 758 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    78.49 
 
 		 1851 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    78.49 
 
 		 758 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  78.8 
 
 		 504 bp  123  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  77.87 
 
 		 758 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  77.87 
 
 		 758 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2448    78.7 
 
 		 420 bp  107  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.190631 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  88.42 
 
 		 426 bp  101  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2447    83.82 
 
 		 198 bp  95.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  0.182777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6072    86 
 
 		 285 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    85.39 
 
 		 754 bp  73.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2784    84.52 
 
 		 449 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    85.33 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    85.33 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    85.33 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    85.33 
 
 		 799 bp  61.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  92.68 
 
 		 261 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  92.68 
 
 		 755 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  92.68 
 
 		 755 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4939    81.37 
 
 		 342 bp  52  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    92.11 
 
 		 356 bp  52  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  93.94 
 
 		 800 bp  50.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    93.75 
 
 		 758 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    93.75 
 
 		 255 bp  48.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    93.75 
 
 		 754 bp  48.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    93.75 
 
 		 758 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>