26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4123 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4161    100 
 
 		 758 bp  1503    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    100 
 
 		 758 bp  1503    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  80.5 
 
 		 393 bp  141  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    82.82 
 
 		 356 bp  133  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    80.56 
 
 		 754 bp  111  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  81.77 
 
 		 261 bp  103  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    80.42 
 
 		 255 bp  103  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  81.77 
 
 		 755 bp  103  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  81.77 
 
 		 755 bp  103  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4153    84.25 
 
 		 759 bp  93.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3881    95.83 
 
 		 752 bp  79.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  81.75 
 
 		 519 bp  73.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  92 
 
 		 864 bp  67.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  97.22 
 
 		 294 bp  63.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.72 
 
 		 755 bp  58  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0860    82.95 
 
 		 311 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 297 bp  54  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  84.85 
 
 		 393 bp  52  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  89.13 
 
 		 288 bp  52  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    87.76 
 
 		 799 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3939    90.24 
 
 		 615 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193056  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6644    90.24 
 
 		 699 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    93.75 
 
 		 781 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>