26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2708 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2708    100 
 
 		 356 bp  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    82.82 
 
 		 758 bp  133  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    82.82 
 
 		 758 bp  133  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    83.77 
 
 		 754 bp  125  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  83.77 
 
 		 755 bp  125  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  83.77 
 
 		 755 bp  125  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  83.77 
 
 		 261 bp  125  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    83.24 
 
 		 255 bp  113  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4153    86.32 
 
 		 759 bp  85.7  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4231    97.5 
 
 		 754 bp  71.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    93.75 
 
 		 799 bp  71.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    93.75 
 
 		 799 bp  71.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    93.75 
 
 		 799 bp  71.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    93.75 
 
 		 799 bp  71.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  92.5 
 
 		 758 bp  56  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  92.5 
 
 		 504 bp  56  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  92.5 
 
 		 758 bp  56  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    92.5 
 
 		 1851 bp  56  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    92.5 
 
 		 758 bp  56  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6165    92.11 
 
 		 781 bp  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6142    92.11 
 
 		 850 bp  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2448    92.11 
 
 		 420 bp  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.190631 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7026    91.67 
 
 		 363 bp  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00855723  normal  0.0732275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3881    85.71 
 
 		 752 bp  48.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  85 
 
 		 333 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  85.71 
 
 		 288 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>