37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3881 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3881    100 
 
 		 752 bp  1491    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    95.83 
 
 		 758 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    95.83 
 
 		 758 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  97.56 
 
 		 519 bp  73.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4246    88.24 
 
 		 544 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0588831  normal  0.0567275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.14 
 
 		 755 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 561 bp  67.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 561 bp  67.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 561 bp  67.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 390 bp  67.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  95.12 
 
 		 393 bp  65.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  92.86 
 
 		 426 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  92.86 
 
 		 755 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  92.86 
 
 		 755 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4153    83.53 
 
 		 759 bp  58  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  87.5 
 
 		 426 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.91 
 
 		 758 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.91 
 
 		 758 bp  56  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  89.58 
 
 		 390 bp  56  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  94.44 
 
 		 390 bp  56  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  94.44 
 
 		 390 bp  56  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  94.44 
 
 		 294 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  94.44 
 
 		 390 bp  56  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    85.07 
 
 		 754 bp  54  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    100 
 
 		 754 bp  54  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 		 369 bp  54  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 		 369 bp  54  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  96.67 
 
 		 351 bp  52  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  82.02 
 
 		 758 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  82.02 
 
 		 504 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  82.02 
 
 		 758 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3782    82.02 
 
 		 1851 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2670    82.02 
 
 		 758 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  90.24 
 
 		 864 bp  50.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2784    85.71 
 
 		 449 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    85.71 
 
 		 356 bp  48.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 2058 bp  48.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>