65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3954 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3954    100 
 
 		 754 bp  1495    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  89.32 
 
 		 369 bp  406  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3927    86.85 
 
 		 424 bp  406  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.821582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  89.28 
 
 		 369 bp  383  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  89.28 
 
 		 369 bp  383  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  88.99 
 
 		 369 bp  375  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  84.73 
 
 		 396 bp  305  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  84.78 
 
 		 339 bp  260  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  84.78 
 
 		 339 bp  260  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  84.78 
 
 		 339 bp  260  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  91.63 
 
 		 294 bp  260  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  84.78 
 
 		 339 bp  260  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0806    86.45 
 
 		 273 bp  240  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  94.26 
 
 		 351 bp  186  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  87.25 
 
 		 369 bp  99.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  87.63 
 
 		 387 bp  97.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3761    87.63 
 
 		 759 bp  97.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8190    81.14 
 
 		 533 bp  85.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.531231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8467    84.69 
 
 		 324 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0621  hypothetical protein  87.5 
 
 		 252 bp  63.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.88144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  81.67 
 
 		 342 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  81.67 
 
 		 348 bp  63.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  94.87 
 
 		 390 bp  61.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  97.14 
 
 		 519 bp  61.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  94.87 
 
 		 561 bp  61.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  94.87 
 
 		 561 bp  61.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  94.87 
 
 		 561 bp  61.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  94.87 
 
 		 390 bp  61.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  84.93 
 
 		 348 bp  58  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  84.93 
 
 		 348 bp  58  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  84.93 
 
 		 348 bp  58  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  96.88 
 
 		 372 bp  56  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3881    100 
 
 		 752 bp  54  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  83.33 
 
 		 342 bp  52  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  96.55 
 
 		 441 bp  50.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  90 
 
 		 348 bp  48.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  90 
 
 		 348 bp  48.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  83.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  93.75 
 
 		 372 bp  48.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  83.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  93.75 
 
 		 372 bp  48.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3289    93.75 
 
 		 372 bp  48.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>