35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3761 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3761    100 
 
 
759 bp  1505    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0109    93.35 
 
 
383 bp  549  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8190    85.95 
 
 
533 bp  105  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.531231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    87.63 
 
 
754 bp  97.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  86.05 
 
 
351 bp  75.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  85.11 
 
 
369 bp  75.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3927    88.52 
 
 
424 bp  65.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.821582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  82.83 
 
 
369 bp  61.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  90.91 
 
 
342 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  90.91 
 
 
348 bp  56  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2660    84 
 
 
404 bp  54  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293823  normal  0.612085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0312    92.11 
 
 
262 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>