19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4153 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4153    100 
 
 		 759 bp  1505    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    84.25 
 
 		 758 bp  93.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    84.25 
 
 		 758 bp  93.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2708    86.32 
 
 		 356 bp  85.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  91.53 
 
 		 755 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  91.53 
 
 		 755 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  91.53 
 
 		 261 bp  77.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  81.16 
 
 		 519 bp  67.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  85.39 
 
 		 393 bp  65.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  88.89 
 
 		 426 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  85.71 
 
 		 393 bp  60  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1975    91.11 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.506795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3881    83.53 
 
 		 752 bp  58  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1779    91.11 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0156739  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1253    91.11 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0734    91.11 
 
 		 799 bp  58  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348265  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0490    87.5 
 
 		 255 bp  56  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.712256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    87.5 
 
 		 754 bp  56  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2739    88 
 
 		 165 bp  52  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>