23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0860 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0860    100 
 
 		 311 bp  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  82.76 
 
 		 393 bp  117  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  91.3 
 
 		 393 bp  60  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    86.15 
 
 		 754 bp  58  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    82.95 
 
 		 758 bp  56  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    82.95 
 
 		 758 bp  56  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3788    100 
 
 		 198 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 444 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 411 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  100 
 
 		 402 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3794    100 
 
 		 198 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  100 
 
 		 528 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3321    100 
 
 		 198 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0718234  normal  0.259191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1011 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 924 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 366 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 147 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>