38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3321 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 444 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3321    100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0718234  normal  0.259191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1011 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 924 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  100 
 
 		 528 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3788    100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3794    100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 360 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  100 
 
 		 402 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 411 bp  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  99.32 
 
 		 147 bp  276  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  99.32 
 
 		 366 bp  276  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  87.77 
 
 		 348 bp  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  87.77 
 
 		 348 bp  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  87.67 
 
 		 537 bp  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  89.8 
 
 		 198 bp  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  82.54 
 
 		 354 bp  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  84.44 
 
 		 225 bp  101  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 bp  95.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  86.11 
 
 		 297 bp  95.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  84.38 
 
 		 372 bp  95.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  84.38 
 
 		 372 bp  95.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  80.41 
 
 		 348 bp  83.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  80.41 
 
 		 348 bp  83.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  80.41 
 
 		 348 bp  83.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  83.2 
 
 		 348 bp  81.8  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  83.2 
 
 		 348 bp  81.8  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8467    81.29 
 
 		 324 bp  69.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  80.67 
 
 		 315 bp  67.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0939  transposase orfA IS5 family element  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.195774  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  86.67 
 
 		 621 bp  56  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  86.67 
 
 		 621 bp  56  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0860    100 
 
 		 311 bp  46.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>