76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1821 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  98.15 
 
 		 336 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  98.15 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  98.15 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  98.15 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  98.15 
 
 		 307 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  97.56 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  97.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  90.48 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  92.68 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  92.68 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  87.8 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  87.8 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  87.5 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  82.93 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  82.93 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  82.93 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  82.93 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  82.93 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  82.93 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  80.49 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  73.17 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  70 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  70 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  90 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  61.22 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  67.5 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  93.75 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  65 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  62.5 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  62.5 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  57.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  60 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  83.33 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  86.67 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  50 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2917  hypothetical protein  45.9 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  64.86 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.1 
 
 		 251 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  59.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  59.46 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  59.46 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2318  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0132  hypothetical protein  52.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  48.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  48.78 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  48.78 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.22 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.22 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0119  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0765731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  56.76 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.5 
 
 		 659 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  54.05 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0589  hypothetical protein  29.21 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  48.72 
 
 		 144 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1785  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  51.43 
 
 		 294 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>