23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37300    100 
 
 		 883 bp  1750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  99.44 
 
 		 885 bp  1709    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3120    88.19 
 
 		 532 bp  133  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6644    93.33 
 
 		 699 bp  65.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3939    93.33 
 
 		 615 bp  65.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193056  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5459  transposase IS4 family protein  91.3 
 
 		 1098 bp  60  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00365854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3975    88.64 
 
 		 754 bp  48.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  90 
 
 		 864 bp  48.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  90 
 
 		 438 bp  48.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  93.75 
 
 		 513 bp  48.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  87.5 
 
 		 474 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  87.5 
 
 		 531 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  87.5 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  87.5 
 
 		 531 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  87.5 
 
 		 531 bp  48.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>