18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6644 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6644    100 
 
 		 699 bp  1386    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3939    99.84 
 
 		 615 bp  1211    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193056  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    98.84 
 
 		 228 bp  163  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  89.83 
 
 		 534 bp  69.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  87.32 
 
 		 513 bp  69.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37300    93.33 
 
 		 883 bp  65.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  93.33 
 
 		 885 bp  65.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8190    92.86 
 
 		 713 bp  60  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  96.67 
 
 		 312 bp  52  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20960  putative Transposase, IS4 family  96.67 
 
 		 384 bp  52  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4123    90.24 
 
 		 758 bp  50.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3098    86.79 
 
 		 363 bp  50.1  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0584    90.24 
 
 		 898 bp  50.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0482    90.24 
 
 		 898 bp  50.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0987444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  90.24 
 
 		 396 bp  50.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  90.24 
 
 		 396 bp  50.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5549    90.24 
 
 		 898 bp  50.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4161    90.24 
 
 		 758 bp  50.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>