37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3940 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3940    100 
 
 		 228 bp  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    100 
 
 		 144 bp  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6644    98.84 
 
 		 699 bp  163  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3085    94.55 
 
 		 429 bp  85.7  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  89.23 
 
 		 438 bp  73.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  89.23 
 
 		 864 bp  73.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 456 bp  71.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 456 bp  71.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 456 bp  71.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6914    87.69 
 
 		 321 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4165    89.58 
 
 		 841 bp  56  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  90.7 
 
 		 767 bp  54  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4006    90.7 
 
 		 764 bp  54  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0379    92.31 
 
 		 780 bp  54  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  83.78 
 
 		 531 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2793    89.13 
 
 		 444 bp  52  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  83.78 
 
 		 474 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  83.78 
 
 		 369 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4227    88.89 
 
 		 793 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0923396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4229    88.89 
 
 		 793 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.344496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  93.94 
 
 		 767 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2910    85.71 
 
 		 869 bp  48.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    88.64 
 
 		 144 bp  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  87.23 
 
 		 531 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  96.3 
 
 		 411 bp  46.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  91.43 
 
 		 800 bp  46.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  87.23 
 
 		 531 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3679  transposase  88.37 
 
 		 261 bp  46.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  93.55 
 
 		 567 bp  46.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>