25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4165 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4165    100 
 
 		 841 bp  1667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4229    83.98 
 
 		 793 bp  547  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.344496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4227    83.98 
 
 		 793 bp  547  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0923396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6917    88.39 
 
 		 601 bp  541  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2793    89.63 
 
 		 444 bp  470  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0379    83.03 
 
 		 780 bp  468  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2792    88.4 
 
 		 375 bp  385  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6914    91.21 
 
 		 321 bp  343  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  86.74 
 
 		 366 bp  337  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  86.74 
 
 		 366 bp  337  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  86.74 
 
 		 366 bp  337  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  83.89 
 
 		 456 bp  293  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  83.89 
 
 		 456 bp  293  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  83.89 
 
 		 456 bp  293  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0246    83.76 
 
 		 261 bp  137  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    92.94 
 
 		 144 bp  121  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6145  putative IS1648 transposase  81.86 
 
 		 273 bp  97.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  97.3 
 
 		 387 bp  65.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2932    97.14 
 
 		 468 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0821023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    89.58 
 
 		 144 bp  56  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    89.58 
 
 		 228 bp  56  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2794  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 1017 bp  48.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  93.75 
 
 		 806 bp  48.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  93.75 
 
 		 806 bp  48.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  96.43 
 
 		 915 bp  48.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>