22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5549 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 555 bp  1100    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  100 
 
 		 396 bp  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 555 bp  1100    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  100 
 
 		 396 bp  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0482    100 
 
 		 898 bp  1780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0987444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0584    100 
 
 		 898 bp  1780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5549    100 
 
 		 898 bp  1780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23610    89.29 
 
 		 889 bp  95.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.574272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  86.14 
 
 		 384 bp  89.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  86.14 
 
 		 384 bp  89.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19860    86.32 
 
 		 384 bp  85.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.85437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06890    87.95 
 
 		 646 bp  85.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352243  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06940    87.95 
 
 		 646 bp  85.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06880  hypothetical protein  81.82 
 
 		 285 bp  71.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06950  hypothetical protein  81.82 
 
 		 285 bp  71.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  92 
 
 		 913 bp  67.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  90 
 
 		 913 bp  60  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  90 
 
 		 913 bp  60  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3939    90.24 
 
 		 615 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193056  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6644    90.24 
 
 		 699 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2910    93.94 
 
 		 869 bp  50.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216552  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  93.75 
 
 		 411 bp  48.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>