52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1051 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1051  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2497  hypothetical protein  50.67 
 
 
244 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214172  normal  0.228117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1620  hypothetical protein  50.91 
 
 
245 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54156  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4183  hypothetical protein  52.51 
 
 
249 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3506  hypothetical protein  50.21 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.661963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3754  hypothetical protein  52.51 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29720  hypothetical protein  50.22 
 
 
243 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1671  hypothetical protein  49.79 
 
 
249 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.465572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3683  hypothetical protein  53.99 
 
 
254 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43910  hypothetical protein  52.51 
 
 
254 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0903  protein of unknown function DUF599  42.86 
 
 
247 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0912  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0877  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3459  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0844  hypothetical protein  41.96 
 
 
244 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0817  hypothetical protein  41.96 
 
 
244 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3123  hypothetical protein  41.96 
 
 
244 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.723349  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2375  hypothetical protein  47.95 
 
 
243 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0813656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3776  hypothetical protein  41.96 
 
 
244 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3102  hypothetical protein  42.41 
 
 
244 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3000  hypothetical protein  40.34 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2715  hypothetical protein  40 
 
 
243 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172605  hitchhiker  0.0000759068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3285  hypothetical protein  39.74 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1017  hypothetical protein  38.91 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2939  hypothetical protein  39.29 
 
 
246 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0687  hypothetical protein  43.24 
 
 
241 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.548428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2896  hypothetical protein  40.27 
 
 
231 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2253  hypothetical protein  41.07 
 
 
244 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2967  hypothetical protein  36.94 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.829543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1890  protein of unknown function DUF599  37.29 
 
 
233 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3224  protein of unknown function DUF599  36.92 
 
 
237 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.65288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0373  hypothetical protein  34.68 
 
 
231 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2999  hypothetical protein  36.92 
 
 
237 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3188  protein of unknown function DUF599  35.45 
 
 
237 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0754  protein of unknown function DUF599  35.78 
 
 
229 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000312427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2745  hypothetical protein  34.08 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451202  normal  0.356517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2066  protein of unknown function DUF599  33.78 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1863  protein of unknown function DUF599  32.88 
 
 
254 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0415114  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1036  hypothetical protein  35 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1810  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1353  hypothetical protein  32.89 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00990342  normal  0.0401411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2884  hypothetical protein  39.73 
 
 
245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.468654  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2503  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3644  hypothetical protein  28.38 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00251577  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2613  hypothetical protein  29.91 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2681  hypothetical protein  30.05 
 
 
251 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1021  hypothetical protein  30.05 
 
 
251 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0474935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0207  membrane protein-like protein  30.14 
 
 
250 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1166  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553601  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1976  protein of unknown function DUF599  26.72 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0287224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1794  protein of unknown function DUF599  27.63 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167691  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1417  hypothetical protein  26.32 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>