50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1976 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1976  protein of unknown function DUF599  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0287224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1794  protein of unknown function DUF599  93.91 
 
 		 230 aa  433  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167691  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1166  hypothetical protein  42.98 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.553601  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3459  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0877  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0903  protein of unknown function DUF599  27.71 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0912  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3102  hypothetical protein  27.83 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3000  hypothetical protein  26.18 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0817  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0844  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3123  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.723349  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3776  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3506  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.661963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29720  hypothetical protein  28.76 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1671  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.465572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4183  hypothetical protein  28.25 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2253  hypothetical protein  25.76 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3754  hypothetical protein  27.8 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1051  hypothetical protein  27.19 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2375  hypothetical protein  28.07 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1017  hypothetical protein  25.43 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43910  hypothetical protein  27.35 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1620  hypothetical protein  26.24 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54156  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3683  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3285  hypothetical protein  24.14 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2939  hypothetical protein  24.57 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2715  hypothetical protein  23.81 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172605  hitchhiker  0.0000759068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0754  protein of unknown function DUF599  29.41 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000312427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3644  hypothetical protein  28.7 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00251577  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2497  hypothetical protein  28.11 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214172  normal  0.228117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2503  hypothetical protein  25.44 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.194881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2896  hypothetical protein  29.9 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0687  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.548428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1890  protein of unknown function DUF599  27.43 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2681  hypothetical protein  27.32 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1021  hypothetical protein  27.32 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0474935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0207  membrane protein-like protein  28.04 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2745  hypothetical protein  28.19 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451202  normal  0.356517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2066  protein of unknown function DUF599  28.44 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2967  hypothetical protein  26.58 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.829543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1863  protein of unknown function DUF599  28 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0415114  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2613  hypothetical protein  26.99 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1810  hypothetical protein  27.98 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0373  hypothetical protein  27.31 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1036  hypothetical protein  26.53 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3188  protein of unknown function DUF599  27.95 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2999  hypothetical protein  26.58 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3224  protein of unknown function DUF599  26.16 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  0.65288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1353  hypothetical protein  25.7 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00990342  normal  0.0401411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>